淄博市审计局内设12个职能科室：办公室、人事教育科、法制科、财政审计科、金融社保审计科、行政事业审计科、经贸审计科、农业环保审计科、外资审计科、政法审计科、科教文卫审计科、经济责任审计办公室。其中经济责任审计办公室分2个科室：经济责任审计一科与经济责任审计二科。

    淄博市政府投资审计专业局内设4个职能科室：综合科、交通能源审计科、城市基础审计科、农林水环保审计科。